上古时代

小精灵阿尔宙斯带领着残破的神奇宝贝世界本源火种而来，为了寻找新世界。

上古洪荒大地就是目标。

那时，万族林立，人类是其中最弱小的一族，那时，“古”还没有崛起，人类还被各种妖兽视为食物。

一天，阿尔宙斯到来，小神奇宝贝与万族发生大战。

史称万族大战。

那一战，远古洪荒被打的破碎，血流大地，洪荒原住民被彻底镇压。

这正合阿尔宙斯的意图。

他试图用小精灵世界本源融合洪荒本源，最终达到掌控洪荒世界的意图。

阿尔宙斯闭关融合本源，它座下各种神兽掌控洪荒世界。

阿尔宙斯手下强大超神兽如云。

天空神裂空座掌握天，大地神固拉多掌地，海神盖欧卡掌海，坐阵洪荒，威压万古。

另外有时间之神帝牙卢卡、空间之神帕路奇犽，毁灭之神骑拉帝亚，森林之神时拉比，守护之神神柱王雷吉奇卡斯，战斗之神代欧奇希斯。

另外两大不弱于海陆空三神的梦幻和超梦。

梦幻被封为生命之神，但是其不管世事。

超梦也是生性不喜争斗，自己找了一处地方自在生活。

然后是顶尖神兽，这些顶尖神兽都被安排在了自己很是的领地。

凤王在固拉多手下，洛基亚在盖欧卡手下，两神兽是喜好和平的神兽，对于洪荒各族并不排斥。

基拉祈作为生性善良，喜欢帮助各族的神兽，在时拉比手下。

然后就是一系列的小神，分管一方，分别是美梦神克雷色利亚，噩梦神达克莱伊，雷神捷克罗姆。

最后就是最弱的元素种族神兽

三神菇蓝圣姑亚克诺姆，黄圣姑由克希，红圣姑艾姆利多。